2018年4月，深圳市委市政府成立市建设深港科技创新特别合作区领导小组，全面统筹领导合作区深圳区域开发建设工作，研究解决合作区深圳区域规划建设中的重大问题。深圳计划在深港科技创新特别合作区进行几个方面的探索：探索实行更为便利的人员出入境政策，为符合条件人员提供绿色通道和无感通关服务；试行科技资金跨境流动政策，设立科技创业投资基金出入境绿色通道；实行科技产业准入制度改革，建设新兴产业标准规则创新先行区，与香港合作发展人工智能、生物医药、金融科技等新兴产业。